A Faculdade de Ciências da Universidade Eduardo Mondlane (FC/UEM) oferece para o nível de Pós-Graduação os seguintes cursos:
a. Treze (13) Cursos de Mestrado, leccionados nos períodos diurno e pós-laboral:
- Mestrado em Biologia e Ecologia de Conservação
- Mestrado em Ciências de Nutrição
- Mestrado em Física
- Mestrado em Gestão do Risco de Desastres e Adaptação às Mudanças Climáticas
- Mestrado em Gestão de Recursos Minerais
- Mestrado em Geohidrologia e Recursos Hídricos
- Mestrado em Informática
- Mestrado em Matemática
- Mestrado em Estatística Aplicada
- Mestrado em Sistemas de Informação Geográfica para o Desenvolvimento Sustentável
- Mestrado em Química e Processamento de Recursos Locais
- Mestrado em Ciência e Tecnologia de Energias Renováveis
- Mestrado em Gestão de Sistemas de Energias Renováveis
b. Dois (2) Cursos de Doutoramento, leccionados no período pós-laboral: