O Departamento de Química possui na sua estrutura interna uma Secretaria, quatro (4) Secções Académicas, uma (1) Secção de Investigação e laboratórios.
Secções Académicas:
- Química Analítica
- Química Orgânica
- Química Inorgânica
- Química Educacional
Áreas de Pesquisa
- Isolamento e síntese de compostos bioactivos
- Química de Óleos Essenciais
- Fitoquímica
- Química dos Alimentos
- Ciência e Tecnologia de Materiais
- Análise Química de Materiais Geológicos
- Química Ambiental
- Química Educacional